1、天窗使用一段时间后会在滑轨、缝隙中沉积不少沙粒，若不定期清理会损伤天窗部件。一般天窗在使用2到3个月后，应把密封胶条或滑轨用纱布沾着清水清洗一下，擦干后可擦拭少许润滑油。切忌抹机油或黄油，因为这两种油黏度较大，更容易沾附许多脏东西。平时或长时间停放前也可以用较细的滑石粉经常清洁，可延长密封圈的使用寿命。
2、在冬季雪后或者洗车后，天窗玻璃与密封胶框有可能被冻住，这时若使用蛮力打开天窗，容易导致天窗电机及橡胶密封条损坏。正确的做法是，在雪后或者洗车后，立刻将天窗打开，擦干边缘残留的水分。并且在洗车的过程中，避免用高压水枪将水柱直接对准密封圈。这样不仅容易是密封圈在高压水柱的压力下变形而是车内进水，也会在一定程度上损坏密封圈。
3、就电动天窗来说，在颠簸的道路中最好不要完全打开天窗，否则会因天窗与滑轨之间的振动太大而引起相关部件的变形，甚至会损坏到电机。
4、必要的时候，对于老化的橡胶条，我们需要更换掉，以保证天窗密封良好。倘若是排水管阻塞，我们需要使用高压风枪去吹通天窗支架排水管，必要时还要拆卸一些附件。